模組化核心課程
國立臺灣大學工業工程學研究所跨領域整合與創新高階主管碩士在職專班所開設之八門核心課程皆為3學分，包括資料科學概論、供應鏈生態系管理、決策分析與產業策略、科技法律與智財管理概論、創意設計與創新管理、跨領域專案與新產品管理、營收與行銷管理、賽局思考與商業競爭。模組化設計課程，每門課由多位臺大各學院教授授課。邀請橫跨臺大工學院、管理學院、電資學院、法律學院，跨院際師資教授八門核心課程，涵蓋企業營運全域，關注企業日新又新發展的各個環節。
資料科學概論
授課教師：藍俊宏、洪英超
了解大數據、人工智慧背後的原理與發展的潛能，再以當前科技產業為例，解析產業整合數據之後，商業模式上面臨的衝擊與不得不做出的相應策略。
供應鏈生態系管理
授課教師：周雍強
先進供應鏈生態系的運作、分析與管理，主題涵蓋交付鏈、快速回應鏈、精實創業、配銷通路、電商平台、運輸配送。
決策分析與產業策略
授課教師：吳政鴻、張時中
決策分析及探討多個決策者的靜態和動態決策問題，並假設其中決策者均有不同決策權限和決策目標，尤其強調相關方法的產業實務應用及相關案例探討。決策分析、動態決策、賽局理論、產業策略
科技法律與智財管理概論
授課教師：陳達仁、李素華
網路與數位科技著作權、專利權理論與實務、生醫科技與智財權、交易秩序與智財權、營業秘密保護、技術移轉與授權契約、智財權訴訟、專利申請、策略聯盟、技術移轉、加值運用
創意設計與創新管理
授課教師：楊烽正、Gideon Loewy
創造力和設計、創意解題法、設計程序、發明與創新、創新管理與模式、創新策略分析、創新商業模式、創新網路與平台、創新設計思考、創新執行分析、創新產業分析、創新環境分析。
跨領域專案與新產品管理
授課教師：陳正剛、陳建良
專案管理計畫、專案組織、專案執行、衝突管理、專案時程規劃、成本控制、風險管理、績效考核、採購談判。
營收與行銷管理
授課教師：黃奎隆、黃恆獎
除講述營收管理的基本概念、對企業營運的影響，也包括了對應的理論與管理科學的方法，如市場區隔、動態定價、降價管理等。行銷管理講述在數位時代與新興商業模式下之行銷方法與理論，亦包含國際行銷相關議題。
賽局思考與商業競爭
授課教師：洪一薰
介紹賽局理論在應用面上的分野，多人(或競爭者)間的決策互動問題、並包含相關理論在營運管理及商業策略上的應用。